이번은, 이야기 초반의 에피소드를 중심으로 등장 캐릭터, 전투 씬등을 소개해 나간다.

【12화】　「옛날 일이군요, 안 좋은일이 있으면 언제나 여기에 별을 보러왔어요」(시온)

　오빠 진과 재회하는 시온이었지만, 그 둘이서 만나는 것이 거북한지, 다시 거리로 발길을 향한다.거기서 우연히 만난 알렌의 격려를 받아 시온은 온화한 기분을 되찾는 것이었다.

【12화】

　U.M.N.관리 센터에서는, 백합·미즈라히 입회아래, 모모의 해석이 시작되려 하고 있었다. 이외로 모모에게  상냥하게 말을 건네는 유리.그러나, Jr.는 그 진심을 감지하고 있었다.완고한 태도를 바꾸지 않는 그녀에게, Jr.는 어린 시절의 숨겨진  약속을 이야기한다.지기는, 일찌기 유리와 같이 아이를 잃었다고 말한 후, 모모도 자신의 딸이라고  생각되지 않는지  그녀에게 제안한다.

【13화】

　모모를 구하기 위해 달려 든 시온과 알렌.알렌의 서포트에 의해, 시온등은 엔세페론 다이브 하지만, 거기는, 모모의 모델이 된 소녀, 사쿠라·미즈라히의 내적 세계였다.14년전, Jr.(루베드)가 가이난(니그레드)이나 알베드들과 함께, 대(対) 우·도우의 훈련을 하고 있던 유리 에프·협회와 사쿠라의 집에서, 시온등은, Jr.의 기억을 체험해 나간다.

【14화】

　알베드는, 불사라고도 할 수 있는 재생 능력을 르베드와 가이난에 과시해 누구나가이렇게 되면 좋다고 말한다.하지만, 그것은 그만의 능력이라고 알고, 거기로부터 조금씩 알베드는 마음이 무너지기  시작한다.

　사쿠라 밑으로다이브 한 르베드들.거기에 갑자기 우·두의 조각이 덤벼 들어, 사쿠라는 무서운 나머지, 도망가 버린다.표준체들은 차례차례로 오염되어 몬스터화해, 르베드등을 덮쳤다.그들에게 붙잡힌 르베드는, 사쿠라를 지키기 위해  알베드를 보낸다.하지만, 간신히 도착했을 때, 사쿠라는--.

　Jr.의 기억은 사쿠라의 죽음에서  끝나지 않았다.시간은, 밀티어  분쟁의 최종 국면을 맞이하려 하고 있었다.이번이야말로 사쿠라의 죽음을 넘어서려는  Jr..그 모습에 시온도 또, 과거를 넘을 결의를 새롭게 한다.현실의 세계에서는, 가이난이 Jr.를 걱정하면서  연방 주성으로 향한다.그러나, 그것은 그의 의지는 아니었다.

【15화】

　전원이 무사하게 엔세페론으로부터 귀환했지만, Y자료는 유출.알베즈는 구 밀티어에  갈수 있는  열쇠를 손에 넣는다.같은 무렵, 밀 티어  분쟁의 무렵에 사망했음이 분명한 디미트리·유리에프가 부활.그의 수단이란--.

　본작은, 「제노사가 에피소드 I [힘으로의  의지]」와「제노사가 에피소드 II [선악의 피안]」을 하나로 묶은  타이틀이지만, 2개의 이야기를 하나의 이야기에 재구성해, 원안에 따른 오리지날의 에피소드가 추가되고 있다.그리고, 에피소드 I 와 II 와는 다른 캐릭터의 시점으로부터 이야기가 말해지거나 원안에는 존재했지만 밝혀지지 않았던 이야기도 나온다고한다..

■ 「알렌, 시온과의 만남」

　묘지에 매장된 것은 , 죽은 사람의 신체만이 아니다.어둡고, 차갑고, 깊고, 조용한 흙속에  다른 것이--.

　잠을 자고 있다 .

■ 「앤드류, 아키타입과의 만남」

　하지만, 동시에 나에게는 또 하나의 얼굴이 있었다--.

　하지만, 두 개의 가면을 손에 넣은 자는  없다.

　나는 단지, 원했을 뿐이었다 .내가 나인 것을 포기하지 않고 , 세계라고 이야기를 주고 받는 방법을--.

■ 「카난, 노이즈가 파묻힌 그 날--」

　무엇보다 그것은--, 사람에 따라서는 다대한 가치를 가지는 것 같다.

　거대한 음모의 진상이라든가, 분쟁의 그림자의 진실에 대해  들었다.

　어쨌든, 나의 임무에는, 관계가 없는 것이다--.하지만, 노이즈는 항상 해석되는 것을 요구하고, 나의 뇌리로 계속 신음한다--.

　그래, 그 때부터--.

■ 논 플레이어 캐릭터 (NPC)

【디미트리·유리에프】Dimitri Yuriev

　생전에 추기원 의원의 한명인, 유리에프·협회의 설립자.Jr.(루베드) 나 가이난(니그레드), 알베드, 시트린등의 U.R.T.V.의 유전자의 제공자.

　당시는 추기원에서도 상당한 실력자이며, 현재에도 연방 내부에 수많은 신봉자가 존재하고 있다.밀티어 분쟁의 무렵에 사망했다고 했지만, 부활을 한다.

【사쿠라·미즈라히】Sakura Mizrahi

　성별：녀
　신장：141cm
　체중：36kg
　연령：향년 12세

　요아킴·미즈라히와 유리의 딸이며, 모모의 모델이 된 소녀.뇌에 선천적인 장해를 가지고 있어 현실에서는  감정을 나타내거나 이야기를  할 수도 없다.치료를 위해, 유리에프·협회로 맡겨졌을 때, 대우·두 용의 훈련을 행하고 있던 루베드와 만나지만, 치료를 겸한 U.R.T.V.의 연습중에 목숨을 잃는다.

【시트린】Citrine

　성별：녀
　신장：140cm
　체중：35kg
　연령：12세 정도

　U.R.T.V.개체 No.668.유리 에프에 의해서 만들어진 668번째의 U.R.T.V.여성체.어떠한 특별한 능력을 가지고 있으며  그것은 니그레드와 같은 것 같다.유년시절, 니그레드와 접촉한 적이 있다.

【헬머】Helmer

　성별：남
　신장：180cm
　체중：75kg
　연령：56세

　제2 밀티어 자치 정부 대표 토의원. 가이난이나 Jr.의 좋은 이해자로, 크카이·파운데이션 설립의 주인공.조할과 우·두의 위험성에 빠를 때로부터 눈치채고 있어 그것들을 미리 막기위해, 현재도 크카이·파운데이션과 함께 다양한 활동을 행하고 있다.군인 시절에는 진의 상관이며, 유리와  유리에프와도 친교가 있었다.

【세르기우스 17세】Sergius X VII

　성별：남
　신장：176cm
　체중：52kg
　연령：72세

　종교 조직 「이민 선단」의 교황.오랫동안, 정치상으로는 나서지 않았지만, 제2 밀키어와 파운데이션에의 혐의 사건을 기회로, 오리지널 조할을 둘러싼 정치의 정식 무대에 등장한다.

■ 그 외의 키워드

【U.R.T.V.】

　우·두레트로 바이러스라고 읽는다.우·두의 파동과 반존재 파장을 가지는 것으로, 우·두와의 대소멸을 목적으로 한 병기.계획의 입안자인 디미트리·유리에프의 유전자 정보를 사용해 대 우·두용으로 만들어진, 생체 병기(데자이너즈 차일드)이다.전부 669체가 제조되어 각각의 고체에는 No.001으로부터 No.669까지의 넘버링이 쓰여져 있다.그 중 변이체에는 고유의 명칭이 붙여져 있다(루베드(Jr.), 알베도, 니그레드(가이난), 시트린).

【혹성 자바로프】

　자르바톨파의 세력이 득세하는  혹성으로, 유리 에프·협회가 개설되고 있다.요아킴과 별거한 유리·미즈라히는, 사쿠라와 함께 이 혹성에 살고 있었다.밀티어  태양계에 가까운 태양계에 속하기 위해, 밀티어 분쟁시는 성단 연방 치안 유지 파견 함대의 근거지가 되었다.

【밀티어 분쟁】

　트알 사변의 최종 국면이 되는 분쟁으로, 시온의 고향인 밀티어가 전장이 되어, 연방 정부군과 U-TIC 기관과의 격전이 전개되었다.연방 정부군은, 밀 치어에 대해 세번의 강하 작전을 실시해, 제3차 강하 작전에는, 특수부대인 U.R.T.V.도 투입하고 있다.기록에서는, 삼차 강하 작전의 때에 U-TIC 기관 창설자인 요아킴·미즈라히에 의해서 발생한  조할의 폭주가 원인으로, 국소 사상 변이가 일어나 밀티어는 누구도 가까이 갈수 없는 곳이 되었다.

【U.M.N.관리 센터】

　제2 밀 치어에 있는 U.M.N.전이 게이트의 관리 시설. 이전에는 베크타·산업의 전이 게이트 제어 시설이었다.현재도 관련 시설, 자재의98%를 벡터가  공급하고 있다.

■ 전투 씬

　캐릭터(E.S.)는, 개성에 맞춘 강력한 기술을 가지고 있다.이것들을 연속 내 고데미지를 줄 수 있었을 경우, 컷 인에 의한 연출 효과가 나타난다.본작에서는 E.S.그리고 이동하는 맵도 있어서, 그 것에서  박력이 넘치는 로보트 배틀을 즐길 수 있다.E.S.에는 파일럿과 서브 파일럿이 탑승하고 있어, 탑승자나 그 편성에 의해서, 기술이 변화한다고 한다.

【컷 인】

【E.S.배틀】